Οι Κλαδικές Ομάδες Εργασίας δημιουργήθηκαν με στόχο να συντονισθούν καλύτερα οι ενέργειες της Ένωσης. Η κάθε ομάδα δραστηριοποιείται στο θεματικό της αντικείμενο και ενημερώνει τα μέλη της Ένωσης για τα συμπεράσματα - αποτελέσματα των ενεργειών της.

Οι ομάδες εργασίας της ΕΠΠΕ είναι:

• Δημοσίων Υπαλλήλων
• Ελευθέρων Επαγγελματιών
• Επικοινωνίας
• Ιστοσελίδας – Newsletter
• Οργάνωσης
• Περιβαλλοντικής Εκπαίδευσης
• Τεκμηρίωσης – επιχειρηματολογίας